Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms