Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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