Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl3Q91YH5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl3Q91YH5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl3Q91YH5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl3Q91YH5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms