Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Stx18Q8VDS8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms