Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Top1mtQ8R4U6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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