Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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