Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms