Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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