Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms