Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TnrQ8BYI9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TnrQ8BYI9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms