Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtpaQ8BWP5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtpaQ8BWP5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtpaQ8BWP5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms