Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms