Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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