Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms