Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms