Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Actn1Q7TPR4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms