Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sbno2Q7TNB8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms