Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms