Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms