Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms