Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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