Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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