Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprdQ64487 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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