Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp7bQ64446 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp7bQ64446 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms