Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Irf4Q64287 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms