Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc18Q640L5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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