Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sall3Q62255 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms