Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rai1Q61818 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms