Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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