Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC051142Q3V0M8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms