Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms