Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp19Q3UJD6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp19Q3UJD6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp19Q3UJD6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp19Q3UJD6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp19Q3UJD6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms