Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms