Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ssbp4Q3U4B1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ssbp4Q3U4B1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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