Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms