Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Usp39Q3TIX9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Usp39Q3TIX9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Usp39Q3TIX9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Usp39Q3TIX9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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