Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms