Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptcd3Q14C51 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms