Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms