Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms