Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms