Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms