Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aplp2Q06335 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms