Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nme2Q01768 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms