Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms