Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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