Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NfybP63139 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NfybP63139 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NfybP63139 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms