Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2nP61089 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms