Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CartptP56388 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms