Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrp1P56183 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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